Comment des structures fonctionnelles aussi complexes que les virus et les réseaux de neurones émergent-elles ? Découlent-elles nécessairement d’un projet intentionnel, voire d’une volonté providentielle ? Ou bien ces ensembles complexes sont-ils capables de s’organiser eux-mêmes ? Henri Atlan tente, dans ce livre, de répondre à cette question fondamentale.

Démontrant ici toute la richesse du concept d’auto-organisation, il fait apparaître les limites des modèles informatiques adoptés par la génétique depuis des décennies ; il fait émerger de nouvelles méthodes scientifiques pour modéliser le réel ; il bouleverse la façon dont inné et acquis se distinguent, se combinent et s’articulent.

D’une redéfinition complète de la cellule à une analyse révolutionnaire des actions volontaires et à une nouvelle conception de l’unité entre le corps et l’esprit, Henri Atlan nous ouvre ici de nouvelles perspectives pour penser la complexité du vivant et de l’humain.

Henri Atlan est à la fois médecin, biologiste et philosophe. Ancien chef de service à l’hôpital de l’Hôtel-Dieu à Paris, il est professeur émérite de biophysique et directeur du Centre de recherche en biologie humaine à l’hôpital universitaire Hadassah de Jérusalem. Il est également directeur d’études à l’École des hautes études en sciences sociales (EHESS).

Henri Atlan a, en particulier, publié L’Organisation biologique et la Théorie de l’information, Entre le cristal et la fumée, Les Étincelles de hasard, qui ont été de grands succès.

1. Couverture
2. Titre
3. Copyright
4. Introduction
   1. Comment des choses peuvent-elles s’organiser elles-mêmes ?
   2. Essai de définition préliminaire de l’auto-organisation
   3. Repères historiques
   4. Structure de l’ouvrage
5. Biologie moléculaire et sciences de l’information
   1. Information génétique et biosynthèse des protéines
   2. La métaphore du programme génétique et ses extensions
   3. Signification de la complexité
6. Organisation et information : la complexité par le bruit
   1. La complexité par le bruit, un principe d’auto-organisation
   2. Impossibilité logique de l’auto-organisation ?
   3. Quelques applications
   4. L’auto-organisation, une notion transdisciplinaire
   5. Excursion en littérature
7. La cellule comme « machine d’états » ou « automate épigénétique »
   1. La complexité d’une cellule
   2. La cellule, un réseau évolutif
   3. Héritabilité génétique et héritabilité épigénétique
   4. Gènes de développement et « programme de développement »
8. La complexité biologique, paradigme des systèmes naturels complexes
   1. À la redécouverte de la complexité…
   2. Les choses et leurs modèles
   3. Sous-détermination des modèles par les observations
   4. Variabilité individuelle et reproductibilité des observations
9. Modèles continus, modèles discrets et modèles génériques
   1. Les modèles continus, analyse et évaluation
   2. Les modèles discrets : automates en réseaux
   3. Les modèles génériques : de bas en haut et retour
10. Typologie des auto-organisations
    1. Le paradoxe de l’auto-organisation programmée
    2. Structures et fonctions
    3. Premier type : les auto-organisations au sens faible
    4. Deuxième type : les auto-organisations au sens fort
    5. Troisième type : les auto-organisations intentionnelles
11. Modèle mécanique d’intentionnalité
    1. Intentionnalité mécanique ou états mentaux ?
    2. Modélisation de l’action intentionnelle
    3. Fécondité du nouveau modèle de l’action intentionnelle
12. L’action intentionnelle et le problème corps/esprit
    1. Neurophysiologie des actions volontaires
    2. Le problème corps/esprit
    3. Vers une « neurophysiologie » spinoziste ?
13. Retour sur les choses et leurs modèles : comprendre et expliquer
    1. Qu’est-ce qu’une explication scientifique ?
    2. Dans l’émergence, qu’est-ce qui émerge ?
    3. Être une idée et avoir des idées
    4. Le temps et les idées du temps
14. Références bibliographiques
15. Table des illustrations
16. Index
17. Index des noms