Les « microbes » ne sont plus ce qu’on pensait qu’ils étaient !

La microbiologie a radicalement changé de visage ces dernières décennies : les microbes, en particulier les bactéries, sont d’une grande diversité, bien plus souvent bénéfiques que pathogènes, vivant en sociétés complexes, capables de communiquer entre eux, d’interagir et de participer à des symbioses avec les organismes qu’ils colonisent.

Chez la plante, l’animal ou l’homme, le rôle des biofilms et des microbiotes, véritables sociétés de bactéries, est enfin reconnu, et les stratégies des Listeria, salmonelles et autres staphylocoques dorés, d’une incroyable sophistication, dévoilent peu à peu leurs secrets.

C’est d’ailleurs en étudiant le système immunitaire d’une bactérie qu’a été mis au point le système CRISPR/Cas9, couteau suisse moléculaire puissant permettant d’« éditer » l’ADN à la manière d’une machine à traitement de texte. Les bactéries ? Des êtres vivants en pleine révolution !

De la résistance aux antibiotiques aux bactéries luminescentes du calamar, de l’éradication des moustiques vecteurs du paludisme aux bactéries « terroristes » et aux mystères du microbiote intestinal, c’est à un tour d’horizon très complet de la microbiologie qu’invite ici Pascale Cossart, spécialiste mondialement réputée.

Ce livre s’adresse à tous ceux qui veulent découvrir le monde fascinant des bactéries, y compris les non-scientifiques !

Pascale Cossart, professeur à l’Institut Pasteur, titulaire de nombreux prix internationaux, est secrétaire perpétuel de l’Académie des sciences. Ses travaux portent sur l’élucidation des stratégies des bactéries pathogènes intracellulaires – en particulier Listeria – et leurs mécanismes de régulation.

1. Couverture
2. Titre
3. Copyright
4. Dédicace
5. Préambule
6. Première partie - De nouveaux concepts en microbiologie
   1. Chapitre 1 - Les bactéries : beaucoup d’amies, peu d’ennemies
   2. Chapitre 2 - Les bactéries : des êtres unicellulaires très organisés
   3. Chapitre 3 - La révolution de l’ARN
   4. Chapitre 4 - Des systèmes de défense CRISPR à la méthode CRISPR/Cas9 pour modifier les génomes
   5. Chapitre 5 - La résistance aux antibiotiques
      1. La découverte des antibiotiques
      2. Les sulfamides entrent en jeu
      3. Mode d’action des antibiotiques
      4. Les antibiotiques chez les animaux
      5. Des premières résistances à la panique mondiale
      6. Quelles solutions, quels espoirs ?
      7. La phagothérapie
      8. Bdellovibrio : pourquoi pas !
7. Deuxième partie - La vie sociale des bactéries : la socio-microbiologie
   1. Chapitre 6 - Les biofilms : quand les bactéries s’assemblent
   2. Chapitre 7 - Les bactéries communiquent entre elles : langage chimique et quorum sensing
   3. Chapitre 8 - Quand les bactéries s’entre-tuent
      1. Les bactériocines
      2. Inhibition de la croissance dépendant d’un contact bactérie-bactérie
      3. Sécrétion de type VI : attaque et contre-attaque !
   4. Chapitre 9 - Les symbioses bactéries-animaux : les microbiotes
      1. Le paradigme du calamar Euprymna scolopes et de la bactérie Vibrio fischeri
      2. Le microbiote intestinal
      3. Le microbiote intestinal, producteur de composés variés
      4. L’évolution du microbiote intestinal au cours de la vie
      5. Obésité et métabolisme
      6. Microbiote et stimulation du système immunitaire
      7. Microbiote, bactéries pathogènes et dysbiose
      8. La dysbiose et les transplantations fécales
      9. Alimentation et microbiote
      10. Le rythme circadien et le microbiote
      11. Le microbiote de la peau
      12. Le microbiote vaginal
      13. Les termites et leur microbiote intestinal
      14. Composition du microbiote, molécules de signalisation et quorum sensing
      15. Le microbiote et la longévité : les études chez la mouche
   5. Chapitre 10 - Les symbioses bactéries-plantes : les microbiotes des végétaux
      1. Microbes et racines : l’underground
      2. La fixation de l’azote : un exemple de symbiose facultative
      3. Les communautés bactériennes de la phyllosphère
      4. Bactéries et croissance des plantes
   6. Chapitre 11 - Les endosymbioses
      1. Un couple fusionnel : le puceron du pois et la bactérie Buchnera
      2. Autres insectes, autres symbioses
      3. Quand les bactéries contrôlent la fertilité
      4. Des bactéries et des vers
      5. Des bactéries dans le noyau des cellules et leurs mitochondries
8. Troisième partie - Biologie des infections
   1. Chapitre 12 - Bactéries pathogènes, grands fléaux et nouvelles maladies
      1. Les grands fléaux de l’humanité
      2. Les maladies infantiles
      3. Les infections intestinales
      4. Les infections nosocomiales
      5. Les maladies sexuellement transmissibles
      6. Bactéries « bioterroristes »
      7. Les maladies nouvelles
      8. Les maladies des pays en voie de développement
   2. Chapitre 13 - Les multiples stratégies des bactéries pathogènes
      1. L’apport de la biologie moléculaire et de biologie cellulaire
      2. Certaines bactéries adhèrent aux cellules mais n’y entrent pas
      3. Bactéries invasives
      4. L’apport de la génomique
   3. Chapitre 14 - Les insectes et leurs bactéries pathogènes
   4. Chapitre 15 - Les plantes et leurs bactéries pathogènes
      1. Agrobacterium tumefaciens et les OGM
      2. Des bactéries pathogènes pour les plantes et les insectes
   5. Chapitre 16 - Visions nouvelles face aux infections
      1. La théorie génétique des maladies infectieuses
      2. La sécurité sanitaire face à la mondialisation des risques
9. Quatrième partie - Les bactéries sont des outils
   1. Chapitre 17 - Les bactéries, sources d’outils pour la recherche
      1. Les enzymes de restriction
      2. La PCR
      3. Bactéries et optogénétique
      4. La révolution CRISPR/Cas9
      5. Les bactéries pathogènes pour comprendre les cellules eucaryotes
   2. Chapitre 18 - Les bactéries : anciens et nouveaux outils pour la santé et la société
      1. Les bactéries dans l’alimentation
      2. Les probiotiques
      3. Transplantation fécale
      4. Le microbiote intestinal des insectes vecteurs
      5. La méthodologie CRISPR/Cas9 et la thérapie génique
      6. La biologie synthétique
   3. Chapitre 19 - Les bactéries : outils pour l’environnement
      1. Bacillus thuringiensis, biopesticide contre les larves de lépidoptères
      2. Bacillus subtilis pour protéger les racines des plantes
      3. Wolbachia et le biocontrôle de maladies infectieuses transmises par les moustiques
10. Conclusion
11. Appendice
12. Bibliographie
    1. I. De nouveaux concepts en microbiologie
    2. II. La vie sociale des bactéries : la socio-microbiologie
    3. III. Biologie des infections
    4. IV. Les bactéries sont des outils
13. Crédits iconographiques
14. Remerciements
15. Table